故事发生在日本的江户时代，一名神秘的男子出现在了武士桂小太郎（石田彰 配音）的面前，他手握妖刀“红樱”，要求试刀，这个夜晚之后，桂便下落不明。桂的宠物伊丽莎白（高松信司 配音）找到万事屋的神乐（钉宫理惠 配音）和新八（坂口大助 配音），委托他们寻找主人的下落。同时，银时（杉田智和）也受到委托，寻找四处作恶的红樱的下落。三人的线索汇聚到了一艘空中飞艇上，由于远离警察的管辖范围，飞艇里的恶势力一手遮天。在那里，银时遇见了曾经的战友现在的对手高杉晋助（子安武人 配音），高杉正带领着自己的鬼兵队企图毁灭江户。一面是穷凶极恶的恐怖分子，一边是暴虐嗜血的妖刀红樱，身受重伤的银时能够平安脱险拯救江户吗？ 　　此次剧场版重制了《银魂》动画中的《红樱篇》，其中，在原作中未出场的真选组也将在故事中大显身手。

在地球灭亡前的倒计时即将来临之时，曾经的盟友银时、高杉、桂，各自的想法在心中奔走。阻挡在银时他们面前的，是教导他们童年时代的师父吉田松阳的另一个人格虚。为了援助银时他们，新八和神乐，还有真选组和歌舞伎町的各位，以前的对手们也站了起来。

银魂完结篇即将上演，坂田银时（杉田智和 配音）在影院抓住一个盗录的电影小偷，谁知刺眼的白光之后，他却被带到一个颇有些陌生的世界。不远处的江户，曾经的繁华早已不再，高楼大厦已变成没有人居住的废墟。原来此刻银时正身处五年后的未来，过去的岁月里，名为“白诅”的神秘病毒恣意蔓延，导致世界濒临毁灭边缘。他在荒芜的街道见到了飒爽英姿的志村新八（阪口大助 配音）和武功高强的神乐（钉宫理惠 配音）。似乎未来世界的银时当初为调查白诅而意外死亡，新八与神乐继承了他和万事屋的遗址，与一切恶徒作战。化名阿珍的银时回到破败的街道和朋友们身边，此时他仿佛背负起改变黑色未来的重大使命……

在最新剧场版《名侦探柯南：万圣夜的新娘》上映当天，总结高木刑警和佐藤刑警的原创总集篇将播出。包含了很多经典章回，TV205 ~ 206话本厅刑事恋爱物语3，TV253 ~ 254本厅刑事恋爱物语4，TV304震动的警视厅1200万人质，TV358 ~ 359本厅刑事恋爱物语5，TV535陈旧的伤痕与刑警的灵魂，以及赌上性命的恋爱直播。

正值万圣节之际，东京涉谷热闹非凡。涉谷HIKARIE大厦里正在举办一场婚礼，身着婚纱的便是——警视厅的佐藤警官。当柯南等宾客都在见证这场婚礼的时候，突如其来的暴徒向佐藤扑去！高木为了保护佐藤而受伤，好在性命无忧。可这时映入佐藤眼里的，是三年前爆炸事件松田阵平殉职时出现的死神的幻影，这一次出现在了高木的身上。 与此同时，那场连续爆炸事件的犯人越狱了！这是巧合吗？ 这个犯人同时也是公安警察降谷零（安室透）宿命的敌人，因为他害死了自己的同学松田。在即将追到犯人之际，突然出现了一个神秘的变装人物，给安室装上了项圈炸弹。为了解除项圈炸弹，柯南赶到了安室潜伏的地下避难所。柯南从安室口中得知了另一桩事件——三年前，安室和警校同学（现已亡）在涉谷遇到了身份不明的变装炸弹犯「普拉米亚」。 然而这时，危险已经开始笼罩搜查中的柯南等人……

堪称动画史上的最强对决到来！传奇大盗鲁邦三世（栗田贯一 配音）和他的战友次元大介（小林清志 配音）、石川五卫门（浪川大辅 配音）来到东京，以怪盗基德之名挑战日本警察和柯南（高山南 配音）。在此之后，鲁邦高调寄出预告书，扬言要盗取某银行内的稀世珍宝樱桃蓝宝石，为此国际刑警组织（ICPO）的鲁邦三世专门搜查官钱形幸一警部（山寺宏一 配音）与目暮警官（茶风林 配音）为代表的日本警视厅通力配合，决心给大盗迎头痛击。另一方面，意大利偶像歌手艾米里翁·瓦力迪（入野自由 配音）赴日卡演唱会，但威胁杀害偶像的恐吓信也随之而来。 　　人声鼎沸的演唱会会场，史无前例的对决拉开序幕

时光流转，当年的少男少女们长大成人，在爱情的护佑下朝着各自的理想而努力。浅仓南（日高のり子 配音）毅然放弃已取得无数辉煌和成就的艺术体操，转而追随摄影师藤村刚但当一名摄影助理；上杉达也（三ツ矢雄二 配音）则受邀赴美，成为垫底球队翡翠队的一名选手。在20世纪50年代，翡翠队曾经名噪一时，如今却成为人人得而虐之烂队。球队老板心怀理想，投入全部家产经营球队。而达也等人的到来也似乎为该队注入全新的活力。在这期间，老板的女儿艾丽丝也开始对达也萌生好感…… 本片根据漫画家安达充的同名原作改编，为该系列动画的第二部原创TV SP。

草薙素子之后，巴特与侦探出身的陀古萨结为搭档。近期发生多起机器人偶杀害主人继而自杀的事件，由于受害者家属均无公诉，且死者中有政客与公安官员，于是公安9课派出巴特小组调查此案。杀人人偶皆为荒凉地带公司出品的哈德莉机型，应部分顾客要求，该机型同时具备异性玩伴的功能，巴特从荒凉地带公司出货官遇害入手，卷入与黑帮的战斗，期间有人入侵他的大脑，使其自残。巴特决定直奔荒凉地带总部，他与陀古萨拜访了择捉岛上的黑客基姆，后者布下系统陷阱，幸有素子提出警告避免陀古萨陷入控制。依靠基姆这条线索，巴特登上了荒凉地带公司设立在海上的工厂船，素子再次降临他的身边，与其并肩作战。

世界最大的体育盛会“WSG -World Sports Games-”将在东京举办。日本为配合开幕式庆祝，结合日本所有先进技术丶最高时速达1000km的“真空超电导新干线”将在新名古屋站和东京新建成的芝滨站之间开通。 在世人目光的注视下，知名大会赞助商汇集的会场遇到突发事件，企业老板相继被绑架。在背后监控这起事件的赤井秀一，以及等待赤井指令的FBI成员们的身影。根据柯南的推理，与15年前的在美国波士顿发生的禁忌的WSG连续绑架事件存在关系，并确定当时的事件也是FBI负责的。