西元2026年，被称为“电脑眼镜”的眼镜型透明显示器已经在全世界普及了11年。在电脑内才存在的虚拟宠物、道具、或是互联网都可以戴上电脑眼镜来看到。 暑假结束时，优子（正确的念法为ゆうこ，Yūko，但通常被称为ヤサコ，Yasako）与双亲还有妹妹京子搬家到大黑市，在抵达大黑市过马路的时候看到了不可思议的事情与在原住地金泽从来没有看过的道具。同时遇见了另一个“ゆうこ”，通常被称为イサコ（Isako）的天泽勇子，以及其他的小孩子们，于是开启了优子在大黑市冒险的日子。

故事发生在战国时代，普通人家出身的男孩猪名寺乱太郎祖辈曾是忍者，在父亲的劝说下，他离开家乡摄津，进入当时一流的忍者学园学习。在学校，他认识了与之同龄的新兵卫和雾丸。新兵卫是一个出身富商家庭的小胖子，为人迷迷糊糊，对吃尤为感兴趣；雾丸则是身世贫苦的孤儿，为人精明，贪财吝啬。这三个性格迥异却的小家伙成为好朋友，他们最大的共同点就是经常因为考试不及格受到处罚。当然，以校长大川平次涡正为首的老师们也都是性格古怪且鲜明的爆笑人物，乱太郎他们和周围的同学、老师一起上演了连番搞笑、有趣的精彩好戏……

十一岁少女阿丽斯相信世界上存在魔法，阿丽斯幻想只要懂得魔法，就可令沉闷的生活添上色彩。 有一天，阿丽斯竟然得偿所愿，被送到一个神秘世界，遇上见习魔女舒拉及艾华。第一次见到魔女，知道梦想有机会实现，令阿丽斯感到十分兴奋；但两个见习魔女初次见到人类，就显得非常惊讶。 原来魔法世界并非阿丽斯所想像的美好。在这裏魔法师会四处捕捉妖精，囚禁在妖精捕获所， 利用妖精来得到法力；魔法就只是魔法师满足个人私利的工具。 不知道魔法师需要妖精才拥有法力，只见到被囚禁妖精的阿丽斯，竟然将全部妖精放走。舒拉及艾华未能及时阻止，只有目送所有妖精逃离捕获所。

因为看得见妖怪而被人类疏远的女子夏目玲子，为了打发寂寞的日子，她向妖怪们发起挑战，并将败在自己手下的妖怪的名字写在一纸契约上，以此做为妖怪们成为自己属下的证据。 玲子的孙子夏目贵志得到了那些契约书所做成的“友人帐”，还继承了玲子的力量，能看到不会显现在人前的物体。而且也和玲子一样成为了被周围人疏远的一员。 可是，作为唯一继续了玲子血统的他却做出了一个重要的决定：将玲子夺过来的妖怪们的名字一一归还。在这样的夏目的身边，开始聚集起各种各样的妖怪们……能看到妖怪的少年夏目贵志，与招财猫外表的妖怪喵先生一起，为大家讲述一个奇异、悲伤，怀念、令人感动的怪谈故事。

旅行者奇诺（Kino）骑着她那会说话的摩托车汉密斯（Hermes）到各个国家旅行，在每个国家奇诺都只停留三天，在她体会了该国家人民的文化、风俗之后，她便离开并前往另一个国家…… 　　--世界は美しくなんかない　そして それ故に 美しい-- 　　--The World Is Not Beautiful,Therefore It Is-- 　　--这个世界并不美丽，然而，又因此而美丽--

由于残忍的分尸杀人事件频发，世界各地人民陷入一片惶恐不安之中，然而元凶却是人类未曾意料到的“寄生兽”。这些寄生生物的幼虫侵入人类或动物身体后，以寄生脑部为目标，寄生完成后与脑部细胞同化，管理这个“死掉的身体”。它们能任意变形，能够迅速吸收掌握人类知识，而它们的食物便是寄生体相同的物种。 　　 普通高中生泉新一（岛崎信长 配音）某天被一只奇怪的虫子侵入身体并吞噬了右手，自此他不得不与寄生生物“右”共存。本性正直善良的泉新一不敢将这一变故告诉家人和朋友，然而他喜欢的人村野里美（花泽香菜 配音）似乎留意到他身体的变化。为了被寄生生物杀死的亲友以及所有人类的未来，泉新一决心与其他完全体寄生兽进行殊死搏斗。