在地狱博士意图征服世界的野心被击溃后，却有股潜伏于地底的新势力趁虚而起，那就是正打着坐收渔翁之利算盘的“迈锡尼帝国”，开始以“战斗兽”大肆挥军攻向地面。仍还浸溺于和平之中的光子力研究所遭遇到了另一场空前未有的新危机，甲儿乘坐着建造研发的大魔神划过夕阳从天而降，轻而易举地将来犯敌军通通一扫而空。

在“伯尼之家”孤儿院长大的甜甜是一个活泼开朗的疯丫头，但是当甜甜被送到富豪伊莱莎家族之后，她却过着每天都要被欺负的日子。不过在甜甜的面前又出现了她很小时候遇到的“白马王子”——十分吸引甜甜的安东尼，而且甜甜也意外地成为了安德鲁家的养女，就在她以为幸福就要到来的时候……

西历2977年，地球上的一切争斗都消失了，每天过着和平生活的人类慢慢地陷入了堕落之中。这时，由于侵略者玛泽恩的攻击地球已经陷入了巨大的危机之中，可是地球人却都毫不在乎，只有宇宙海贼哈洛克和伙伴们一起驾驶着宇宙战舰阿尔卡迪亚号抵抗着侵略者。

“火鸟是传说中的不死鸟，它可以穿越时空，不死不灭，阿拉伯人叫它费利克斯，中国人则称它们为凤凰，火鸟不会死亡，它们会在火中重生……”在漫画中手冢以火鸟做为线索，探讨生命的秘密讲述生命的故事。发生在不同时空里的十二个故事，虽然主角、时代、背景各不相同，但却有着共同的主题和内在的联系。读者随着火鸟一起纵横驰骋在人类的历史和未来里，体验手冢对人类文明、生命的意义以及宇宙本源的思考。富坚义博擅长峰回路转的悬念，但与之相比仅仅是玩弄结构游戏的小聪明；高桥留美子擅长刻画生活，但一比之下也变成了毛皮。在这部作品面前《凯普》那号称鬼斧神工的奇幻想象显得平淡无奇；《暗黑破坏神》和《五星物语》也再配不上“波澜壮阔”这样的修饰。并不是说这些作品不好，仅仅是因为《火鸟》实在是太优秀了，用两个字形容就是“广博”。就像手冢自己概括的：“一定要说这部作品的主题那就是：‘在某个时间的某个地方，有某个生命在发出声音……’”是啊，武士和强盗，机械人和外星生命……它们共同演绎的是生命的主题，在时空的大河里一个生命可以渺小的连沙子都不如，但并不代表它不存在。美好的梦想可以眨眼间被打得粉碎，但整个宇宙的生命大合唱却生生不息，永无休止，就好象火中的凤凰……

地球人的殖民星——索罗星（ソロ星）上，存在着被地球人称为第六文明人的外星人遗留的遗迹。当地球人正在对遗迹进行调查时候，外星人巴夫克兰（バッフ‧クラン）人为了探查传说中的无限能量伊迪（イデ）之力而来到他们称为洛过达（ロゴ‧ダウ）的索罗星。 出于对外星人的恐惧，巴夫克兰人不分青红皂白的便向地球人开了火，主人公科斯莫（ユウキ‧コスモ）等索罗星殖民者们为保卫自己的生命，驾驶第六文明人遗留的巨大机器人伊迪安（イデオン）同巴夫克兰人战斗。 随后，乘坐另一遗迹——宇宙船索罗船（ソロシップ）开始了他们那看不见尽头般充满悲伤的逃亡生活……

住在魔法界的拉拉贝尔有一天和比斯卡斯一起掉进了人间界，并且无法回到魔法界，而人间界的立花老夫妇温柔地接受了她。虽然对人间界的东西完全不懂，拉拉贝尔还是遇到了各种各样的事情并且慢慢地了解到了人间的美妙。

U.C.（宇宙世纪）0079年，人类向宇宙发展并建立了多个巨大的卫星，让人类能够居住在宇宙中。卫星的居民们不堪忍受地球联邦政府对其剥削和压迫，遂宣布独立，更组建军队与地球联邦政府决一雌雄。在战争中双方先后开发了机动战士并投入战场。NEWTYPE少年阿姆罗·雷无意中驾驶上联邦军新开发的机动战士高达，卷入后来被称为“一年战争”中，并与其宿敌夏亚·阿兹纳布尔相遇。

由于银河能量变弱的原因，宇宙发生了巨大的变化，凶恶的空间怪物开始到处暴乱。而为了解决当前的危机天凤公主必须要前往大王星，这时被选为护卫的就是孙悟空、猪八戒以及沙悟净这三个骑士。