故事的开头如同《迷失》一样，始于一架即将出事的飞机。在迫降之后飞机上所有人都死于一种神秘的病毒，FBI以及各方调查组介入调查。但这只是故事的开始，接下来FBI的女特工奥利弗-邓哈 姆(Olivia Dunham)和高智商天才彼得-毕舍普(Peter Bishop)将携手面对一系列匪夷所思的可怕现象。为了阻止危机的进一步扩展，他们将寻求彼得早已疏远的父亲的帮助。而他的父亲沃特-毕舍普博士(Dr. Walter Bishop)则一直被精神病院所收留。出院之后，三个人组成的调查小组开始对各种离奇事件进行研究。随着遇到的事情越来越棘手，沃特-毕舍普博士背后不为人知的一面也逐渐浮出水面。片中出现的一个名为巨能(Massive Dynamic)的前沿科技公司也跟沃特-毕舍普博士颇有渊源，它的创始人曾跟他同在一个实验室共事。但巨能公司的诡秘行为却不得不让人怀疑它跟一系列神秘事件脱不开关系，不过偶尔也会为奥利弗等人提供一些帮助，这让它的真正目的变得更加扑朔迷离。到底巨能公司是为了拯救人类不遗余力的正义天使还是妄图将整个地球变为自己可以为所欲为的实验室的幕后黑手？随着奥利弗等人的深入调查，真相将逐渐水落石出。

本片融警匪与法庭于一体的电视剧，片中讲述的犯罪基本原于真实生活，往往是近期报纸上的头条新闻。节目分为两部分，上半部分介绍警察研究现场，征询证人，提审嫌疑犯等一系列的侦破活动，后半部分详尽记录了案件侦破的后期工作，案件转交到检查官手里，检查官衡量案情，起诉，直到庭审，节奏紧凑，扣人心弦。由于最终坏人不一定被绳之于法，所以观众看的时候往往暗自捏一把汗。

本片融警匪与法庭于一体的电视剧，片中讲述的犯罪基本原于真实生活，往往是近期报纸上的头条新闻。节目分为两部分，上半部分介绍警察研究现场，征询证人，提审嫌疑犯等一系列的侦破活动，后半部分详尽记录了案件侦破的后期工作，案件转交到检查官手里，检查官衡量案情，起诉，直到庭审，节奏紧凑，扣人心弦。由于最终坏人不一定被绳之于法，所以观众看的时候往往暗自捏一把汗。

迈克尔·斯科菲尔德的兄弟林肯·伯罗斯即将以谋杀罪被处以死刑，但迈克尔坚信他是被冤枉的。为了拯救自己的手足，迈克尔抢劫了一家银行，因此得以与林肯关进同一所监狱——福克斯河州立监狱。作为一名建筑工程师，迈克尔对监狱的建设蓝图了如指掌，带着林肯逃出生天成为迈克尔入狱的唯一目的。

吉米·基恩（塔伦·埃哲顿 饰）出生在芝加哥，是一名警察的儿子。他曾是一名出色的橄榄球球手，并朝着职业道路发展。而他犯的错使他被判 10 年监禁，无假释机会。检察官给他一个将功补过的机会，但风险很高。有一个叫拉里·霍尔（保罗·沃尔特·豪泽 饰）的人绑架和谋杀了一个 15 岁女孩，而这个女孩仅仅是他过往杀害的 19 名女性之一，由于证据不足，霍尔或将被释放，基恩的任务就是在狱中让霍尔承认他的谋杀行为。

这个系列的重点是纽约警察局的重案组，一支调查高调案件的侦探队伍，同时也从罪犯的角度向观众展示部分犯罪。

出生于巴基斯坦移民家庭的高中生纳兹（里兹·阿迈德 Riz Ahmed 饰），偷偷开走父亲的出租车去赴一场朋友爽约的派对。他中途迷路，焦急之际搭载了带着落寞绝望表情的女孩安吉拉（索菲亚·布莱克-德埃利亚 Sofia Black-D'Elia 饰）。霓虹闪烁的海边，两人互吐心声。纳兹随对方回到家中，在迷幻的氛围中一切自然而然地发生。可当他醒来时，却发现安吉拉已被人残忍杀害。他惊慌失措，夺路而逃，结果半路因酒驾遭到逮捕，继而因涉嫌杀害安吉拉遭到指控。在押期间，善于为边缘人辩护盈利的小律师约翰·斯通（约翰·特托罗 John Turturro 饰）决定帮他洗脱罪名。临近退休的警长丹尼斯（比尔·坎普 Bill Camp 饰）和检察官海伦（珍妮·柏林 Jeannie Berlin 饰）则磨刀霍霍，发誓要坐实纳兹的罪名。被人称为有着“小鹿斑比似的大眼睛”的纳兹，更要在炼狱般的牢房内接收黑暗和罪恶的洗礼……