明智一家表面和睦温馨，然而随着老年痴呆的爷爷（笑福亭松之助 饰）的去世，隐藏在家族内部的危机逐渐浮了上来。父亲芳郎（平泉成 饰）看似按时上下班，但实际早已丢了工作，外面债台高筑；贤惠的母亲章子（大谷直子 饰）随着岁月的流逝，渐渐厌烦了好妈妈好太太的角色，心中倍感压抑；女儿伦子（つみきみほ 饰）实现了当老师的梦想，却被不听话的学生惹的烦恼不堪。当然，在爷爷葬礼期间，芳郎那个因盗窃而被逐出家门的儿子周治（宮迫博之 饰）也回到家中。一家人各有各的烦恼，也各有各的秘密……

由于父母离异，刚满10岁的忠志（神木隆之介饰）只好跟母亲来到乡下跟外公一起生活。一次偶然，忠志参拜神社时被选为“麒麟送子”。当地有个传说，被选为麒麟送子的孩子可在大天狗山顶，拿到传说中大天狗守护的飞剑。传说那飞剑是用来维护和平的，伙伴们揶揄他不敢上大天狗山取麒麟送子的宝剑。他在尝试一半后，被吓回来。 　　另一方面，千年魔人加藤保宪（丰川悦司饰）复活，他利用废旧物品的怨气，将其与抓来的妖怪们扔到大怨灵炼火中融合形成邪恶的怪物军团，并率领它们企图毁灭人类。在山神、河童和川姬等妖怪的努力下，忠志通过了考验。为了保卫世界，忠志决定和妖怪们齐心合力，和大恶人决一死战，妖怪大战争正式展开！

某一天，宇宙人西里里来到小新家中，并使用特使光线把变爸爸野原广志和妈妈野原美伢回了小孩子模样，如果想恢复现状，必须帮助西里里找回自己的父亲，就这样大家踏上了寻找之旅……